强直性脊柱炎基本病理变化为外感风寒湿为因，湿热瘀阻兼肾督虚损为果。而活动期以湿热瘀阻兼肾督虚损是矛盾的主要方面。中医对强直性脊柱炎这种疾病来讲，曾有过描述和记载。例如《素问•痹论》云：“骨痹不已，复感于邪，内舍于肾。”又云：“骨痹者，尻以代踵，脊以代头。“这与强直性脊柱炎出现的脊柱强直、行动不便、驼背畸形等临床表现颇为相似。《灵枢•经脉》说：“动则病冲头痛，目似脱，项如拔，脊痛，腰似折，髀似折，髀不可以曲，腘如结，踹如裂，是为踝劂。”其中“髀”相当于髋关节，“病冲头痛”、“项如拔”、“脊痛”、“腰似折”是强直性脊柱炎的典型表现，而“髀不可以曲，腘如结，踹如裂，”则是强直性脊柱炎的外周关节的症状。总体上看祖国医学认为本病属于痹证范畴内的骨痹、肾痹、历节风、竹节风等。本病病因方面，主要有以下几个方面：

　　先天不足，肾精亏虚：先天禀赋不足，肾气不足，骨失所养，外邪乘虚而入;或房劳过度，肾精不足，水亏于下，火炎于上，阴火消烁，真阴愈耗;或病久阴血暗耗，阴虚血少，成为发病的内在基础。强直性脊柱炎为何以少年发病，青年时期病情发展，现代医学已证实了强直性脊柱炎的发病与遗传有密切关系。

　　肝肾亏虚，肾精不充：肾主骨生髓，脊柱为一身之骨主，骨的生长发育又全赖骨髓的滋养，而骨髓中精气充足骨髓充盈，刚骨髓发育正常，坚固有力：肾中精气不足，骨髓空虚，则骨质疏松，酸软无力。督脉“循背而行于身后，为阳脉之总督，督之为病，脊强反劂”。青少年本为肾精不足，髓不得充，骨失所养，肾虚及肝，筋失濡润，导致骨质脆弱、筋脉不柔，皮肉不坚，成为外邪侵入的病理基础。

　　外感寒湿，郁而化热：由于居住潮湿、涉水冒雨、冷热交错等原因，导致阳气不足，卫外不固，风寒湿邪乘虚侵入，注入经络，流于关节，使气血郁闭而发病。然风寒湿邪侵体，正气尚弱，且湿性粘滞缠绵，诸邪不能及时外散，寒湿留连不去，郁闭气日久，可导致“寒盛则生热”、“重寒则热”而化为热毒，“若邪郁病久，风变为火，湿变为痰”可郁而化热火，变生热毒，阻滞血脉，流注关节发为热痹。此即《类证治裁》所云：“初因风寒湿郁闭阴分，久则化热攻痛。”

　　湿热伤阴，阴虚内热：强直性脊柱炎其活动期的基本病理变化为湿热瘀阻兼肾督虚损。湿之形成责之于湿从外袭或脾虚生湿，内外相合，湿流骨节。与风寒热诸邪相合，从阳化热或郁而化热，湿热内生，蕴结为毒，攻注关节，热与血互结，或邪热灼伤血脉，或热伤阴津，血脉干涩，均可导致血瘀。如《张氏医通》言：“两腰偻废乃热邪深入血脉久闭之故。

　　阴虚血热，湿热瘀阻：湿热瘀相互蕴结，相互影响，湿、热阻于经脉，影响气血运行，刚瘀血内生或加重，反之，瘀血又进一步阻遏气机，使气机不畅气不化津反成湿，或气机不畅，郁而化热，湿热交炽，终至湿热瘀痹阻经络，流注骨节，着于肾督。“督脉者，起于胞中，贯脊属肾”。《素问•骨空论》言：“督脉为病，脊强反折。”青少年本为肾精不足，髓不得充，骨失所养，肾虚及肝，筋失濡润，导致骨质脆弱，筋脉不柔，可致湿热毒之邪气着于筋骨，侵蚀破坏骨髓筋脉，甚则湿热郁久成毒，攻噬筋骨，出现骨节之不坚、无力、沉重、强直、身体屈曲，甚至则龟背，畸形等晚期临床表现。